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課程名稱 |
微生物學特論
Special Topics in Microbiology |
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開課學期 |
108-2 |
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授課對象 |
生物資源暨農學院 農業化學研究所 |
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授課教師 |
林乃君 |
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課號 |
AC5085 |
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課程識別碼 |
623EU4510 |
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班次 |
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學分 |
1.0 |
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全/半年 |
半年 |
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必/選修 |
選修 |
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上課時間 |
第1,2,3,4 週
星期一A,B(18:25~20:10)星期三A,B(18:25~20:10)星期五A,B(18:25~20:10) |
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上課地點 |
農化二106農化二106農化二106 |
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備註 |
本課程以英語授課。密集課程。第1週必到，UniversityofWestFlorida鍾慧敏老師合授
總人數上限：30人 |
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Ceiba 課程網頁 |
http://ceiba.ntu.edu.tw/1082AC5085_bioinfo |
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課程簡介影片 |
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核心能力關聯 |
核心能力與課程規劃關聯圖 |
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課程大綱
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為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
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課程概述 |
大家好，在這個為期三個星期的研究課程裡，我們希望和同學一起從生物信息學（Bioinformatics) 的觀點解碼微生物如何用簡單的核酸序列編寫它們的基因，決定所需蛋白質的結構等，進而認識微生物世界的奧妙。 |
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課程目標 |
o熟悉基本生物信息學操作
o解碼噬菌體基因體
o研讀生物信息學文獻
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課程要求 |
Taught in English; a guest instructor, Dr. Hui-Min Chung from
Department of Biology, University of West Florida
email: hchung@uwf.edu
與西佛羅里達大學鍾慧敏博士合授。第一堂 3/2 (一)第 A 節必到。
修過普通微生物學 (或類似課程)
3/2~3/20 每周一、三、五 18:25~20:10 農化新館 106 教室 (請自備筆記型電腦) |
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預期每週課後學習時數 |
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Office Hours |
另約時間 |
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指定閱讀 |
於授課期間公布於網站 |
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參考書目 |
Kieser, T., Bibb, M. J., Buttner, M. J., Chater, K. F., and Hopwood, D. A. 2000. Practical Streptomyces genetics. John Innes Foundation, Norwich, England. |
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評量方式
(僅供參考) |
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No. |
項目 |
百分比 |
說明 |
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1. |
pre-lab quiz |
20% |
open book |
2. |
paper discussion |
20% |
References will be provided in advance and discuss in class |
3. |
progress report |
20% |
during the class |
4. |
final presentation |
20% |
At the end of the class |
5. |
attendance/participation |
20% |
Students are encouraged to discuss and interact with instructors and classmates. Absence in anyone of this course will lead to failure of this class |
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週次 |
日期 |
單元主題 |
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第1週 |
03/02 |
Introduction and bacteriophage biology |
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第2週 |
03/04 |
Genome annotation overview |
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第3週 |
03/06 |
Preparation for annotation |
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第4週 |
03/09 |
Automatically annotating your genome (I) |
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第5週 |
03/11 |
Automatically annotating your genome (II) |
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第6週 |
03/13 |
Refining your annotation (I) |
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第7週 |
03/16 |
Refining your annotation (II) |
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第8週 |
03/18 |
Finalizing your annotation |
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第9週 |
03/20 |
Final presentation |
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